Oltre 1500 campioni raccolti dal 1700 ad oggi tra i quali l’Aragonite coralloide e il tronco fossile mineralizzato a rame nativo rinvenuto a Cà de’ Vanni di Frassinoro (Appennino modenese). In questa collezione sono anche presenti minerali e rocce raccolti nel corso di alcune recenti spedizioni italiane in Antartide. E’ inoltre presente la collezione di pietre lavorate raccolte dall’Arciduca Massimiliano, fratello di Francesco III d’Este.